UFO: Aftershock is een combinatie van tactische squadegevechten en wereldwijde strategie die de prequel, UFO: Aftermath, verbetert en uitbreidt.
Het is het jaar 2054. Vijftig jaar na de ramp. Vijftig jaar nadat het aardoppervlak onbewoonbaar werd. Teruggetrokken in de vliegende haven van de Laputa klampten de overblijfselen van de mensheid zich vast aan het bestaan. Toen escaleerde een opstand tegen het steeds starre en corrupte menselijke leiderschap van de Laputa tot een conflict dat de kolonie verwoestte. Nu vluchten de overgebleven overlevenden opnieuw. Kunnen ze de aarde terugwinnen van de onbekende krachten die hen de lucht in jaagden?
